Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HTRA2O43464 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA2O43464 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA2O43464 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA2O43464 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA2O43464 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA2O43464 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA2O43464 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA2O43464 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA2O43464 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA2O43464 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA2O43464 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA2O43464 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA2O43464 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA2O43464 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA2O43464 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA2O43464 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA2O43464 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA2O43464 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA2O43464 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA2O43464 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA2O43464 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA2O43464 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA2O43464 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA2O43464 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTRA2O43464 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA2O43464 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA2O43464 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HTRA2O43464 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA2O43464 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA2O43464 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA2O43464 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA2O43464 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA2O43464 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA2O43464 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA2O43464 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA2O43464 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA2O43464 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA2O43464 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA2O43464 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA2O43464 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA2O43464 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA2O43464 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA2O43464 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA2O43464 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA2O43464 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA2O43464 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA2O43464 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA2O43464 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA2O43464 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA2O43464 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HTRA2O43464 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HTRA2O43464 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA2O43464 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms