Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBFA2T2O43439 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBFA2T2O43439 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms