Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAA1O43292 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms