Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLXNB1O43157 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms