Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNPATO15228 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNPATO15228 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNPATO15228 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNPATO15228 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNPATO15228 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNPATO15228 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNPATO15228 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNPATO15228 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GNPATO15228 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GNPATO15228 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GNPATO15228 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GNPATO15228 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPATO15228 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPATO15228 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPATO15228 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPATO15228 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPATO15228 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPATO15228 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPATO15228 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPATO15228 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPATO15228 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPATO15228 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPATO15228 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNPATO15228 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNPATO15228 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNPATO15228 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNPATO15228 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNPATO15228 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNPATO15228 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNPATO15228 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNPATO15228 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPATO15228 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPATO15228 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPATO15228 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPATO15228 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPATO15228 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPATO15228 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPATO15228 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPATO15228 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPATO15228 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPATO15228 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPATO15228 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNPATO15228 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNPATO15228 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNPATO15228 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNPATO15228 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNPATO15228 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GNPATO15228 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNPATO15228 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNPATO15228 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNPATO15228 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNPATO15228 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPATO15228 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPATO15228 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPATO15228 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPATO15228 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPATO15228 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPATO15228 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPATO15228 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPATO15228 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPATO15228 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPATO15228 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPATO15228 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPATO15228 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPATO15228 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPATO15228 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPATO15228 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNPATO15228 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNPATO15228 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNPATO15228 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNPATO15228 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNPATO15228 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GNPATO15228 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNPATO15228 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNPATO15228 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNPATO15228 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNPATO15228 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GNPATO15228 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GNPATO15228 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNPATO15228 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNPATO15228 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNPATO15228 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNPATO15228 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNPATO15228 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNPATO15228 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNPATO15228 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNPATO15228 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNPATO15228 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNPATO15228 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNPATO15228 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNPATO15228 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNPATO15228 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms