Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB6O15197 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB6O15197 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms