Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IKBKBO14920 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms