Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF5O00463 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAF5O00463 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms