Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
J3QQQ9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
J3QQQ9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QQQ9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QQQ9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QQQ9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QQQ9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QQQ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QQQ9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QQQ9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QQQ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QQQ9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QQQ9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QQQ9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QQQ9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QQQ9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QQQ9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QQQ9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
J3QQQ9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
J3QQQ9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms