Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01387J3KSC0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms