Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H7C1W4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H7C1W4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H7C1W4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H7C1W4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H7C1W4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
H7C1W4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H7C1W4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H7C1W4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H7C1W4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H7C1W4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H7C1W4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H7C1W4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H7C1W4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H7C1W4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H7C1W4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H7C1W4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H7C1W4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H7C1W4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H7C1W4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H7C1W4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H7C1W4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H7C1W4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H7C1W4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
H7C1W4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
H7C1W4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
H7C1W4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
H7C1W4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
H7C1W4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
H7C1W4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H7C1W4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H7C1W4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H7C1W4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H7C1W4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H7C1W4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H7C1W4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H7C1W4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H7C1W4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H7C1W4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H7C1W4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
H7C1W4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H7C1W4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
H7C1W4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H7C1W4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H7C1W4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
H7C1W4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
H7C1W4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
H7C1W4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H7C1W4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H7C1W4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H7C1W4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H7C1W4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H7C1W4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H7C1W4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H7C1W4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H7C1W4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H7C1W4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H7C1W4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H7C1W4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H7C1W4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H7C1W4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H7C1W4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H7C1W4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H7C1W4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
H7C1W4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H7C1W4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H7C1W4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H7C1W4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
H7C1W4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H7C1W4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H7C1W4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
H7C1W4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
H7C1W4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H7C1W4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
H7C1W4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
H7C1W4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H7C1W4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H7C1W4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H7C1W4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H7C1W4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H7C1W4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H7C1W4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H7C1W4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H7C1W4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms