Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO7DNF2Z398 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms