Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRT4C9JH25 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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