Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4DEV8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
B4DEV8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
B4DEV8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
B4DEV8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DEV8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DEV8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DEV8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DEV8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms