Protein–RNA interactions for Protein: B2RC85

RSPH10B2, Radial spoke head 10 homolog B2, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH10B2B2RC85 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RSPH10B2B2RC85 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPH10B2B2RC85 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms