Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms