Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms