Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMTNL1A8MU46 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms