Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOBPA7XYQ1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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