Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms