Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23AA6NH52 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23AA6NH52 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms