Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC160A6NGH7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms