Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms