Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRAMEF22A3QJZ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms