Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 GFM2-201ENST00000296805 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 LRRC32-203ENST00000407242 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 APOBEC3B-201ENST00000333467 1533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ADAT2-201ENST00000237283 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 MTMR12-202ENST00000280285 4966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 PAK3-204ENST00000372010 2606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ZNF506-202ENST00000450683 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 SPATA18-201ENST00000295213 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ARAP3-205ENST00000513878 3810 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 LINC02069-201ENST00000457449 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC018630.6-201ENST00000536668 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 SLC35F4-203ENST00000554729 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 STAC2-201ENST00000333461 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 BNC2-202ENST00000380667 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 SEC23B-203ENST00000377465 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 METTL2A-201ENST00000311506 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AP003784.1-201ENST00000622964 1749 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 RIPOR1-203ENST00000422602 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 KIRREL3-201ENST00000525144 3808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 NRF1-204ENST00000393230 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC005692.1-201ENST00000461145 1439 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 PSG6-209ENST00000601833 2321 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ZNF599-202ENST00000587354 3476 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ZBTB24-201ENST00000230122 5519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 PIGN-212ENST00000589339 2177 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 DNMT3A-203ENST00000380746 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 KY-205ENST00000508956 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 RHAG-201ENST00000229810 1283 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 OR8B12-201ENST00000306842 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 MIRLET7I-201ENST00000362309 84 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 FAM153A-202ENST00000393518 1138 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 RAB34-212ENST00000453384 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC090955.1-201ENST00000458338 235 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AP001619.2-201ENST00000458654 587 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 IGKV1D-17-201ENST00000483379 532 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ABT1P1-201ENST00000511060 821 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC120114.5-201ENST00000562285 556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC105402.3-201ENST00000601658 784 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 FAM153B-221ENST00000611539 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC121758.3-201ENST00000611595 301 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 FAM153C-213ENST00000620373 1048 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 SERPINE1-201ENST00000223095 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AP003038.1-201ENST00000527289 1754 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 MYO1C-204ENST00000545534 3676 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ZNF827-201ENST00000379448 4197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 PHC2-204ENST00000431992 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 WFDC13-201ENST00000305479 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ARL9-201ENST00000360096 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 BCAS3-202ENST00000407086 3496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 TMEM55A-201ENST00000285419 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 OPTN-206ENST00000378764 2498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 MAP3K7-205ENST00000369332 4830 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC093642.2-201ENST00000625132 4805 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 CR2-202ENST00000367058 4063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 USP28-201ENST00000003302 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 RNF125-201ENST00000217740 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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LMO3Q8TAP4 CDHR2-203ENST00000506348 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 NECTIN4-201ENST00000368012 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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LMO3Q8TAP4 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC004893.2-201ENST00000360902 3398 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 NRXN3-218ENST00000635466 5254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 KIRREL1-201ENST00000359209 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 RBM23-215ENST00000555209 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 PLA2G2C-202ENST00000429261 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC022596.2-201ENST00000635352 3078 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 WDR20-210ENST00000556511 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 ICK-202ENST00000356971 6227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AKR1D1-202ENST00000411726 2234 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 POLR3G-201ENST00000399107 3285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 OR6B3-201ENST00000319423 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AL138729.1-201ENST00000406666 664 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 RPL3P7-201ENST00000417878 1212 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC006509.2-201ENST00000419124 395 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 LATS2-AS1-201ENST00000422510 632 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 RPSAP14-201ENST00000429143 359 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LMO3Q8TAP4 AC005297.3-201ENST00000446214 756 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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