Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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ARL2-SNX15V9GYD0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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