Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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SNX13Q9Y5W8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SNX13Q9Y5W8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX13Q9Y5W8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX13Q9Y5W8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX13Q9Y5W8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX13Q9Y5W8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX13Q9Y5W8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX13Q9Y5W8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX13Q9Y5W8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX13Q9Y5W8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX13Q9Y5W8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX13Q9Y5W8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX13Q9Y5W8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX13Q9Y5W8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX13Q9Y5W8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX13Q9Y5W8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX13Q9Y5W8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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