Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRPRBQ9Y5M8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRPRBQ9Y5M8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms