Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5A7

NUB1, NEDD8 ultimate buster 1, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUB1Q9Y5A7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NUB1Q9Y5A7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUB1Q9Y5A7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms