Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL20Q9Y2M5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms