Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SBNO2Q9Y2G9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms