Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms