Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNEQ9Y223 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNEQ9Y223 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNEQ9Y223 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNEQ9Y223 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNEQ9Y223 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GNEQ9Y223 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GNEQ9Y223 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms