Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML2Q9UQR0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML2Q9UQR0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.9 ms