Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNQ9UQP3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms