Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC5Q9UQL6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC5Q9UQL6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms