Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms