Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH9Q9ULB4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms