Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MSRAQ9UJ68 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms