Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX4Q9UIU6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms