Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms