Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUF60Q9UHX1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PUF60Q9UHX1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms