Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFMBT1Q9UHJ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFMBT1Q9UHJ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms