Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC3BQ9UH17 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBEC3BQ9UH17 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms