Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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