Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRRQ9UBK8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRRQ9UBK8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms