Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL9Q9P2J3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms