Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

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Length 4,599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1BQ9NZR2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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