Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDE1Q9NZC3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDE1Q9NZC3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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