Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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